单细胞测序的终点?不!华盈PCF(原CODEX)技术让空间与蛋白验证“一石二鸟”-技术前沿-资讯-生物在线

单细胞测序的终点?不!华盈PCF(原CODEX)技术让空间与蛋白验证“一石二鸟”

作者:上海华盈生物医药科技有限公司 2025-03-13T00:00 (访问量:418)

在单细胞测序技术蓬勃发展的当下,许多研究者在完成单细胞测序后,常常面临一个棘手的问题:如何进一步推进实验?为了深入挖掘单细胞测序结果背后隐藏的生物学意义,研究者们常常需要借助多种技术手段来搭配单细胞测序。

但搭配技术的选择至关重要:

1、单细胞测序+空间转录组:虽然两者数据容易匹配,但对于组织细胞的研究自始至终都只有转录本的信息,在多组学联合的趋势下往往还需要增加蛋白水平的验证;

2、单细胞测序+空间转录组+流式/多重荧光:整体丰富度虽然提高,但是整体周期和价格较贵,经费压力巨大。同时每多一个技术,数据的分析难度都会增加。

那么有没有一项技术,既可以表征“空间”信息,又可以从“蛋白”层面验证,同时还可以以“单细胞”水平观测组织样本呢?

PhenoCycler-Fusion(原CODEX):单细胞测序后的“黄金拍档”

优势1:空间定位——让单细胞数据回归组织原位

技术亮点:

①超高分辨率(单细胞级)空间蛋白组,精准映射细胞亚群在组织中的位置(如肿瘤-免疫边界、干细胞生态位);

②支持100+蛋白标记同时检测,覆盖关键功能蛋白(如PD-1/PD-L1、细胞周期标志物)。

对比空间转录组:

①空间转录组(如10x Visium)仅提供RNA空间信息,无法直接关联蛋白活性;

②PCF通过蛋白标记直接验证单细胞测序中发现的差异基因通路(如EMT、代谢重编程)。

优势2:蛋白验证——弥补RNA与蛋白表达的不一致性

技术亮点:

①直接检测蛋白表达水平,规避RNA与蛋白表达脱节(如转录后调控导致的差异);

②可筛选出单细胞测序中“假阳性”标志物,提升后续研究可靠性。

对比传统蛋白验证:

①流式/免疫组化需预先猜测目标蛋白,通量低且无法空间定位;

②PCF一次性检测几十种蛋白,无需假设驱动。

优势3:成本与效率——多组学整合的“轻量化方案”

技术亮点:

①单张组织切片即可完成实验,样本需求量低;

②数据可直接与单细胞转录组对齐(如通过细胞类型特异性蛋白标记)。

对比多技术组合:

①传统“单细胞+空间转录组+流式”需多次实验,成本增加2-3倍;

②PCF通过单次实验获得空间+蛋白数据,节省时间与经费。

“单细胞测序不是终点,而是探索的起点!

PCF以一项技术、双重价值,助您将RNA异质性转化为空间-蛋白维度的功能洞察,省去多平台联用的繁琐与成本,让数据闭环一步到位。”

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