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circDB:世界上最全面的环状RNA数据库

作者:上海云序生物科技有限公司 2018-11-06T11:43 (访问量:6429)

circDB:最全面,专业的环状RNA数据库

作为近两年最热门的明星分子,环状RNA的研究尚处于起步阶段。官方数据库circBase存在着环状RNA收录数目少,物种覆盖不全,注释信息缺失等诸多缺陷。为了解决这个问题,云序生物自主开发了当前世界上最全面,专业的环状RNA数据库:circDB

 

最多的物种覆盖,最全的环状RNA收集

circDB数据库不仅收录了circBase中的7个物种,还包含了大鼠,猴子,猪,牛,水稻,拟南芥等,覆盖物种达17个。此外,以人类环状RNA为例,circBase仅收录了9.6万条人类环状RNA,而circDB不仅涵盖了circBase,还收录了所有已发表的代表性文献数据,包含的人类环状RNA数目达20万条。


最细致的环状RNA注释

circDB对每条环状RNA进行了详细的注释,例如:环状RNA的来源,染色体位置,位置分类,序列,长度,来源基因等。以环状RNA的来源为例,circDB是目前唯一覆盖所有已知环状RNA的数据库,能帮助客户发现真正的新环状RNA。此外,circDB还对疾病相关的环状RNA进行了标注,能帮助客户迅速找到研究切入点。


环状RNA图形化展示

circDB提供了所有环状RNA的可视化文件,可以帮助客户在UCSC数据库中轻松实现对环状RNA与其来源基因的图形化展示。



云序生物环状RNA产品:
云序生物是唯一一家能够提供环状 RNA系统性解决方案的科研服务公司,自主开发的circDB数据库是目前世界上最全的环状RNA数据库,产品涵盖了:环状RNA测序,环状RNA定量PCR,环状RNA验证和功能机制研究等。

1. 全转录组测序-同时检测环状RNALncRNAmRNA,一举三得!

2. 环状RNA测序-高效富集环状RNA分子,超高验证率!

3. 环状RNA定量PCR上万对预验证的环状RNA引物,无须摸索实验条件!

4. RIP测序高通量检测与Ago2蛋白结合的环状RNA,助力miRNA海绵机制解析!

5. ChIP测序-全面检测受特定蛋白因子调控的环状RNA,揭示环状RNA调控机制!


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