随着基因组研究的迅速发展，全基因组测序已逐步成为微生物基础研究的重要手段之一。

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将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术，能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。

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Small RNA 是一类长度18-30nt的非编码RNA，主要包括miRNA、siRNA、piRNA三大类。使用二代测序平台对其进行测序及分析。

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LncRNA测序通过高通量测序以及生物信息学分析，对样品中lncRNA及mRNA进行全面的研究，广泛应用于医学、农学等研究领域。

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外显子序列捕获芯片（或溶液）可在同一张芯片上以高特异 性和高覆盖率捕获研究者感兴趣的目标外显子区域，后续利用Hiseq 2000或SOLiD 5500测序仪测序直接解析数据.

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扩增子测序主要对特定长度的PCR产物进行测序分析，针对环境样本，16S测序是研究环境微生物多样性及群落组成的重要技术手段之一。

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降解组测序利用高通量测序技术结合生物信息学手段对这些mRNA降解片段进行大规模鉴定，进而鉴定miRNA调控靶基因的技术。降解组测序技术既摆脱了仅利用生物信息学预测靶基因带来的高假阳性，又避免了常规靶基因鉴定手段（如5’ RACE）低通量耗时耗力的不足，显著促进

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利用特制的探针对客户感兴趣的蛋白编码区域DNA或某段特定序列进行捕获，富集后进行高通量测序的基因组分析方法。该方法能够获得指定外显子&目标区域的遗传信息

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